游戏主线任务的核心分歧与关键推进点在于社区中心的修复或Joja超市的路线选择。在春季第5天之后的晴天进入社区中心，阅读金色卷轴可触发剧情，随后法师会来信指引。玩家可以选择经典的社区中心献祭路线，通过收集各种季节性的物品、作物、鱼类等完成不同房间的献祭束，以修复小镇设施，此过程节奏较慢但能体验到完整的剧情与探索乐趣。另一条路径是Joja超市路线，玩家通过支付金钱而非收集物品来直接解锁同样的社区设施，这条路线更为直接高效，但会错过许多献祭特有的剧情与村民互动，玩家的选择将定义属于自己的星露谷故事。
完成每个房间的收集目标都能解锁重要的设施奖励。这些奖励包括解锁矿车系统以快速穿越山谷、修复温室以实现冬季耕作、以及开通矿洞和沙漠等新区域。收集任务涉及广泛，要求玩家精通耕种、采矿、钓鱼、觅食等技能，并根据不同季节规划活动，例如春季需寻找山葵、水仙等特定作物或foraging物品，而某些鱼类仅在特定天气与时段出现。
社区中心完全修复或所有Joja开发项目完成后，主线剧情将进入更深层阶段。玩家需要前往罗宾家上方的铁路区域触发新剧情，目标是进入一个被封锁的洞口，这需要先获得黑暗护符。获取护符需进入下水道，而进入下水道的前提是向博物馆捐赠至少60个物品以获得钥匙。从下水道的科罗布斯处获得信息后，前往突变虫穴深处找到黑暗护符，即可打开铁路区域的洞口。
进入洞口后的区域关联着法师的魔法秘境与女巫小屋。要进入女巫小屋，需先解决守护在门口的哥布林难题，通常需要提交一份虚空蛋黄酱。进入小屋后，从桌上取得特定药水并在法阵上使用，可直接传送到法师塔的地下室，从而解锁与法师相关的后续剧情及建筑功能，例如建造祝尼魔小屋、黄金钟等高级设施。游戏在标准地图上的核心主线任务流程基本完成，玩家的农场与社区也已得到充分发展。
