厉害的S级忍者通常具备高爆发伤害、强控制效果或多段位移特性，能在战斗开始时就占据优势。经过强化后的秽土转生长门普攻流畅，技能兼具防御、反击和位移，容错率较高。四代目雷影以其卓越的单体爆发和抓取破霸体能力著称。秽土转生三代火影作为忍术大师拥有丰富的技能组合，战术选择灵活。初代火影千手柱间的格挡机制和空中打击能力使其容易在开局取得优势，宇智波斑则凭借广域的技能覆盖与空中位移控制占据上风。须佐能乎宇智波鼬、神威卡卡西等忍者也以其稳定的连招和恐怖的秒杀能力在决斗场中表现出色。
对于侧重副本清理和快速刷图的玩家，厉害的S级忍者评判标准则侧重于大范围攻击、高伤害输出以及流畅的技能衔接。秽土转生三代火影被广泛认为是刷图效率极高的选择，因为他拥有多个可切换的技能，能灵活应对各种场景。初代火影千手柱间凭借超大范围的木遁技能，在造成可观伤害的同时还能为队伍提供增益。天道佩恩的技能组合能将怪物聚集并迅速清场，效率极高。雷影艾则是典型的爆发型忍者，特别适合追求速通高血量目标，须佐能乎系列的忍者也因其技能范围巨大、伤害爆发高而成为快速清场的优选。
获取和培养厉害的S级忍者需要根据玩家自身的资源情况和游戏投入进行合理规划。对于零氪玩家或资源有限的平民玩家，可以通过高活跃度参与限时活动与特殊玩法来获取强力S忍，例如参与组织争霸赛获取猿飞日斩碎片，通过巅峰对决活动用金币兑换大野木或秽土三代风影碎片，或将主力忍者培养至五星后利用碎片转化系统兑换大蛇丸或自来也。对于愿意投入的玩家，合理分配资源优先升级关键技能和装备是提升其战力的核心，同时需要注意通灵兽和秘卷技能的搭配以发挥忍者的最大潜力。
综合当前版本在决斗场、副本以及获取难度等多维度的表现，秽土转生长门、四代目雷影、秽土转生三代火影以及初代火影千手柱间被普遍认为是综合强度最高的几位S级忍者。秽土转生系列忍者因其强大的技能机制普遍强度较高，而初代火影的适用性非常广泛。最终的选择需要玩家结合自身的操作习惯、资源情况以及偏爱的战斗风格来决定，稳扎稳打的玩家可能更适合初代和秽土三代，偏爱激进打法的玩家则可能更倾向于雷影。
